При работата със счетоводен софтуер EJ COTA, за улеснение на потребителите, са предоставени различни варианти на готови сметкоплани, включително браншови и типови, които могат да бъдат адаптирани спрямо специфичните нужди на фирмата. Освен това, програмата включва вградена структура от настроени папки за документи, които могат да бъдат редактирани и разширявани в зависимост от дейността на организацията. В допълнение, разработен е гъвкав механизъм за работа с многомерни системно зададени номенклатури, както и за създаване на потребителски номенклатури.
При обработка на счетоводни документи със счетоводния софтуер EJ COTA се осъществява контрол в реално време на номер на документ, контрагенти и функционалности. Например, апаратът за автоматизирано разсрочване и ползване на ДДС във времето позволява автоматично генериране на протоколи по ВОП. Освен това, програмата предоставя пълен контрол на дневниците по ДДС и VIES декларациите. Реализирана е и проверка на валидността на ДДС номер, като автоматично се попълват данни за нови контрагенти, регистрирани по ДДС, с информация от сайта на Европейската комисия. При обработката на първични документи за доставка и продажба, софтуерът може автоматично да интегрира данни с модулите EJ BONA и EJ FIXA.
Счетоводният софтуер EJ COTA осъществява контрол и управление на задълженията към и от контрагенти в реално време. Освен това, разполага с възможност за копиране на типови документи и контировки, както и използване на вече обработени документи от минали счетоводни периоди. Широко се използват автоматизирани счетоводни операции, включително автоматично осчетоводяване и автоматизиран обмен на данни между модулите на системата. Всеки обработен документ може да бъде съхранен в електронен вид чрез сканиране или директно, ако е генериран от друг модул на EJ System. В допълнение, програмата изготвя и поддържа електронни счетоводни фирмени досиета, които улесняват достъпа до документи.
Софтуерът предлага разнообразие от стандартни и специализирани справки. Например, поддържат се различни видове оборотни ведомости, главна книга, хронологични и аналитични ведомости. Автоматично се формират Годишните Финансови Отчети (ГФО) на база предварително зададени настройки в сметкоплана. Освен това, е разработена функционалност за контрол на фирмените плащания към държавни и местни данъчни институции. В модула има изграден механизъм за управление на реалните плащания по начислените възнаграждения на персонала, както и автоматизирано изпращане на съгласувателни писма за проверка на задълженията от и към контрагенти.
Счетоводният софтуер EJ COTA поддържа импорт на банкови документи от различни български банки, както и импорт на счетоводни документи от външни системи. Освен това, програмата предлага специализирани справки за фирмения мениджмънт, които представят аналитични разрези от икономическото състояние на фирмата за произволни периоди. Тези справки включват информация за разходи, приходи и взаимоотношения с контрагенти. В допълнение, софтуерът разполага с апарат за задаване на бюджет на разходите и следене на изпълнението му по синтетични и аналитични признаци, което е критично за ефективното управление на фирмените финанси.
Поддържа се многоезичност на потребителския интерфейс, като стандартно е включен английски език като втора опция. Тази функционалност осигурява по-голяма гъвкавост при работа с международни контрагенти и документи.
Счетоводният софтуер EJ COTA комбинира прецизност, ефективност и модерни технологии, предоставяйки решения, които улесняват счетоводната дейност и оптимизират процесите във всяка фирма.